一千零一夜1969

　　单纯善良的北白川玉子（洲崎绫 配音）、外刚内柔的常盘绿（金子有希 配音）、我行我素的牧野神奈（长妻树里 配音）和外冷内热的朝雾史织（山下百合惠 配音），四位好友相互陪伴，度过了人生中最快乐的三个年头，如今，毕业季在即，面对尚且处于迷雾之中的未来，四个女孩心中有着隐隐的不安，但更多的，还是对日后生活的希冀和幻想。
　　玉子家中世代经营着一间打糕店，而玉子又是家中的长女，这让玉子不得不开始考虑起了继承家业的想法。与此同时，玉子的青梅竹马大路饼藏（田丸笃志 配音）亦有着自己的选择，尽管他家和玉子家是商店街的竞争对手，但他俨然已经喜欢上了可爱的玉子。

2024年，发生了MM制造公司"濑良野基因混合社"的社长绑架案。在收取赎金现场出现的凶犯，居然让自己脸部在所有监视纪录上留下了贴着笑面标志的影像后成功脱逃。案发后六年，"笑面男"的巧妙陷阱再度出现在网络社会中... 　　封印已久的笑面男苏醒了，特A级黑客与九课的巅峰对决即将拉开帷幕！

　　故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。
　　在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。
　　然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。
　　在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。
　　而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……
　　迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———
　　所有的答案，都在「Link Vrains」中

　　故事发生在遥远的未来时代，日本财政陷入了巨大的危机之中，就在国家即将崩溃之时，一个名为“Sovereign Wealth Fund”的金融机构出现，成功的挽救了摇摇欲坠的日本。尽管经济危机得到了缓解，但城市却因长久以来的缺乏管理而陷入了混乱，失业率、自杀率和犯罪率急速上升。
　　余贺公麿（内山昂辉 配音）的母亲早逝，父亲亦不知所踪，在舅母的抚养下长大成人的他就读于经济学部。家庭温暖的缺失让公麿十分渴望能够拥有一个稳定的家，某一日，他在银行中遇见了一位神秘的男子真坂木（樱井孝宏 配音），男子以公麿的未来作为抵押，借给了公麿大量金钱，公麿就此进入了异空间“金融街”，在那里，有许多和他一样失去了未来的人们，靠着战斗来实现各自的梦想。