魔法科高校的优等生

　　大雄在学校的后山捡到一株被人抛弃的树苗，通过哆啦A梦的植物自由化生长叶，树苗一夜之间变成了蹦蹦跳跳的小家伙，大雄为其取名木木。木木聪明伶俐，热爱学习，不仅得到了野比家所有人的喜爱，也成为胖虎、小夫、静香他们的好朋友。某天，小伙伴们去后山玩耍，结果被吸入到外星飞船之中。由于人类对地球生态环境的破坏日趋严重，一群具有高智慧的植物宇宙人决定将地球上的植物劫持，以挽救它们濒临灭绝的命运。然而，失去植物，地球上的氧气将会减少，人类乃至所有动物都将灭亡。大雄他们能否阻止宇宙人的计划？
　　本片根据日本漫画家藤子不二雄的原作改编。

　　隆（清水宏次朗 配音）和肯（羽贺研二 配音）是年轻的武道家，毕生的理想就是追求更强健的体魄和更强大的力量，为了磨炼技艺，两人结伴而行开始了周游世界的旅程，只为了寻找更加强大的对手，探索各自的极限。
　　一路上，两人遇见了许多和他们志同道合的好友——活泼可爱的春丽（藤谷美纪 配音）、刚正不阿的古烈（津嘉山正种 配音）、不断突破着自我的飞龙（船木诚胜 配音），好友们在一起切磋比试，彼此之间技艺都有了很大的长进，隆更是因为遇见了一位神秘的师父，习得了破坏力巨大的“波动拳”。他们共同的敌人是强大而又邪恶的维加，一行人能否团结一心，组织维加的阴谋呢？

故事紧接着上一集发展着。温蒂（凯斯·索西 Kath Soucie 配音）已经长大成人，并且拥有了自己的家庭和孩子。过去如梦似幻的回忆始终是她汲取精神养分的田地，并且她十分乐意将这个故事告诉她的下一代。 　　作为温蒂的孩子，小飞侠的故事丹尼（安德鲁·麦克多诺 Andrew McDonough 配音）和珍（哈丽特·欧文 Harriet Owen 配音）已经听了无数遍。对于妈妈口中的奇遇和冒险，丹尼坚信不疑，可珍就没这么单纯了，她觉得这只是妈妈编出来哄他们高兴的故事罢了。让珍没有想到的是，故事中的虎克船长（科里·伯顿 Corey Burton 配音）竟然真的现身了，不仅如此，他还把珍绑架到了梦幻岛。小飞侠和小叮当的故事再度开演。

　　20世纪末，一种被称为“B细胞”的物质被发现存在于生物体内，这种物质会直接侵入生物的DNA内部，使其产生异变。科学家们对这种奇妙的物质产生了极大的兴趣，为此进行了多次动物实验，并秘密地准备将B细胞用在人体上。高中生海堂佑司在不知不觉中成为了牺牲品，也因B细胞的活性化而被诊为不治之症，进入了精心安排下的冷冻睡眠。在这段时间内，由于动物体内的B细胞无法通过冷冻来抑制，使其发生了突变增殖引发了物种变化，兔子和小狗成为了巨大的虫状怪物 BLUE。它们在很短的时间内交配繁殖，并将人类当作了自己的食物。整个世界很快就被数量庞大的BLUE所占据，只有1千万左右被选出的人逃到了太空殖民地“第二地球”里，而剩下的人类却只能留在地面上被BLUE所蹂躏……
　　人类的手亲手造出了罪孽，人类的手再次将自己推向无尽的深渊，不是天灾，不是虫孽，只是人祸而已……

进入21世纪已有近20年，在人们已忘记了妖怪存在的现代。

　　科学无法解明的现象频发，流言飞语散布各处，大人们只能疲于奔命。

　　希望想办法解决这一情况而写信给妖怪信箱的13岁少女·真奈的面前，

　　随着咔哒咔哒的木屐响声，鬼太郎来到了…。