毕业前夕，以逆转心衰为己任的王扬鸣因与导师在医学实验上发生分歧，毅然决定从科研转向临床，并顺利入职了全国心血管排名第一的瑞仁医院急诊科。忙碌的急诊科生活激起了王扬鸣的竞争本能，他冒险处理老人室颤，解救热射病农民工，救治脑中风病人，不断精进医术，并与胖子路易、祖闻达和刘非组成了患难与共的“急诊四杰”。四人相互见证了彼此的成长和改变，收获了友情爱情，也经历了聚散离合，但不变的是：哪里有最危重的病人，他们就会出现在哪里。当王扬鸣面对医疗生涯中最棘手的心脏病人，四杰重新相聚，同战困难，终获成功。
女演员田净植因为一场车祸，阴差阳错的苏醒了基因突变人薛灵乔，二人经历磨难，消除彼此的误解，陷入爱情。为了让田净植过上平凡的生活，薛灵乔选择离开。不久后，田净植怀孕，薛灵乔担心田净植母子的安危，秘密住在田净植家隔壁。田净植偶遇云臻，二人志趣相投。云臻向“准妈妈”田净植展开了强烈的追求攻势。以秋月白为首的“S组织”得知田净植怀了薛灵乔的孩子，以小舅的身份留在田净植身边，实则利用田净植母子为组织谋利。与此同时，田净植身体出现排异反应，而城中的女性失踪案屡次发生。为了保护心爱的人，更加为了避免殃及无辜，薛灵乔再次卷入这场基因突变人引起的风波中，设法解除危机。事件解决之后，田净植肚中的宝宝顺利出生，一家三口幸福的生活在一起。
失忆总裁沈池宴把哑女妻子宋柒年当作秘书，甚至让她作白月光的备用血包。宋柒年有口难言，企图帮沈池宴找回记忆却失败。苏醒的白月光使计破坏宋柒年的家庭，在爱情破碎和亲人离世的多重刺激下，哑妻居然开口了！
野鸭子和杨顺一起离开都市，回到农村并重新将养鸭场做得风风火火，就在一切看上去顺风顺水的时候，二人要结婚办喜酒却重新将“认不认生母”这个敏感话题引了出来。同时也成了串起杨家、周家、方家这几个家庭生活，纠葛几家关系并引发出种种矛盾摩擦的导火线。面对接踵而来的婆媳矛盾、 怀孕生子、前女友生病这一系列棘手难题时，野鸭子用执着、不放弃和乐观向上的精神鼓舞和感染着大家。演绎了一部使观众在捧腹的同时，亦能感受人与人之间的真情与真爱的积极向上的励志故事。
该剧根据真实的历史事件编写而成，反映了雾都解放前夕，国民党准备在撤离大陆之前炸毁雾都的兵工厂和重要基础设施，表现了国共两党的殊死较量和尖峰对决。剧作通过三大家族在风云激荡的乱世之秋中的兴衰沉浮以及方梦凯、罗丹和董海妹之间奇特的情感际遇和命运描写，演绎出剧中主人公面对强敌以及敌人的罪恶阴谋，同仇敌忾，决死抗争，慷慨赴死，不惜抛头颅洒热血的崇高爱国主义精神。
民国，察哈尔地区，张家口最大商号之一“鼎兆通”桀骜不驯的少东家秦天义，这一天正坐于日本商会大和洋行的会馆院中，当着日本商会会长渡边正雄的面，光明正大地击毙了两名杀害自家驼夫的日本浪人。从此一切便变得一发不可收拾，渡边正雄更加加紧了对察哈尔地区的秘密经济侵略行动。 在与外侵势力斗争过程中，秦天义被冤入狱，屡次死里逃生。兄弟与爱人之间的情感纠葛，竟翻出了秦家的一个惊天秘密，也正因为此，兄弟之间反目成仇，日本人趁机一夜之间血洗秦家，秦天义决意复仇…在他发现了日本人在察哈尔地区的真正意图之后，他坚定了报此家仇的决心，作为一名中国人，他更加坚定了报此国恨的决心，誓死要把日本人赶出去！ 这是一场爱恨情仇纠缠不清的家族争斗，这是一出云谲波诡悬念迭起的复仇迷局，这是一曲感天动地的浩然正歌。义道，正义之道，忠义之道，情义之道，又为本剧主人公秦天义之道路之意。 家人，兄弟，爱人以及脚下的这片土地。这是他们要去誓死保卫的东西。
苏小鹏（苏有朋）从台北来到上海准备接收祖产老房子，消息一号，一贯平静的老房子里顿时风声鹤唳谣言四起，住户都开始打起如意算盘。 老房子里一户家中无男人的三口人家，女主人看重女儿学业，为其找来了四川妹子吉祥作补习老师。吉祥一直想摆脱自己身上的泥土味做个真正的上海人， 然而无论她怎样努力，老房子里的住户仍当她是乡巴佬。但在苏小鹏眼中，吉祥和其它人一样也是上海人，这令吉祥十分开心，开始以上海人的身份带着苏小鹏深入上海的大街小巷，经过朝夕相处，两人生出真情，却遭遇苏小鹏远在台北的父亲的阻拦。
本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除了史可、李婷、刘冠军等几位观众熟悉的演员外，大多数演员都是新面孔。
