第一机械厂发生火灾，财会室烧死了四个人，工人的工资也全烧。共损失金额一百九十多万。消防队长发现有回火来到现场勘察，从墙里挖出弹头。根据弹道学原理，发现这并不是简单的火灾而是持枪抢劫大案。地面证据，死者位置都被变动了，从墙上弹痕判断，杀人凶手是两人，先灭口、后用炸弹焚屋炸毁现场，案发现场遭到两次破坏。警察认为此案有许多疑点，对此案提出三个主要疑点，没有放入此案的案卷中，所以将不能作为合理翻案的最关键的证据重新调查还此案一个真相。
抗日战争时期，上海。租界地区由于其特殊的历史因素成了被日军包围的孤岛，各种抗日力量在中共地下党的领导下如雨后春笋般破土而出，正是在这个特殊时期，五个身怀绝技的国民党女特工悄然而至。特高课长竹内掀起了一股屠杀抵抗力量的血雨腥风，一时间无数仁人志士倒在了侵略者的枪口和屠刀之下，哪里有压迫哪里就有反抗，这天，竹内再次带人抓捕抵抗力量，却落入了复仇者所设的陷阱。对面制高点上，陈春雪的狙击步枪早已瞄准了这个双手沾满中国人鲜血的刽子手。竹内的被杀激怒了日军高层的神经，他们调来特工高手织田，伺机反扑......
玉茗格格（李小冉 饰）深受父皇乾隆（许文广 饰）喜爱，她在宫里天不怕地不怕，只怕一种东西，那就是毛毛虫。玉茗无事在民间闲逛，结识了几个年龄相仿的伙伴。随着年龄增长，格格喜欢上了上官锦弘（卲峰 饰），但她做梦都想不到上官竟是她同父异母的哥哥，这是当年父皇一夜风流欠下的孽债，两人自不知情，兀自真诚相爱。乾隆得知宝贝女儿爱上了上官锦弘，龙颜大惊，设计将玉茗许配给和珅之子殷德（苗海忠 饰）为妻，遂向玉茗道出实情，玉茗闻言芳心俱焚，拉着上官跳崖殉情，不料殉情未果，玉茗成了疯子，上官则失去了记忆。不久，宫里传来流言蜚语，和珅之子殷德竟是乾隆的私生子......
解放前的旧上海，各方势力云集于此，鱼龙混杂，动荡不安。这里是政要富豪的博弈场，是穷苦百姓的炼狱，是当之无愧的魔都。三毛（孟智超 饰）是一个身形瘦小、脑袋圆圆、只有三根头发的男孩。他自幼丧父，为了寻找外出谋生的母亲，这个未经世事的男孩来到上海。在这个云集着大资本家、军阀、投机商人、洋人、流氓、骗子、小偷、舞女、妓女以及千千万万穷苦百姓的都市里，三毛品尝着酸甜苦辣，见识着这个混乱时代的光怪陆离。他柔弱的臂膀担负着太多与这个花季年龄不相匹配的东西，但即便如此，三毛仍然保持着善良正直的品性…… 本片根据张乐平同名原著漫画改编。
本季节目继续选择13个具有话题性的城市或空间，每集连续 72个小时进行拍摄，对镜头前的人物进行访问，让被访者讲述自己的故事和内心历程，并用25分钟浓缩记录中国人的生活状态。希望观众能够在陌生的城市中，发现熟悉的角落，在别人的故事里看见自己，体会他人。跟第一季相比，有更多描绘新时代的生活面貌，更为活跃新奇的精神世界，情感依然真实朴素。
